Το σχολείο λειτούργησε για πρώτη φορά το σχολικό έτος 1980-81 ως παράρτημα του 1ου Λυκείου Ζακύνθου.
Το 1985 ανεξαρτητοποιήθηκε. Όλα αυτά τα χρόνια λειτούργησε συστεγαζόμενο με το Γυμνάσιο Κατασταρίου έως και το 1986, όταν και στεγάστηκε στο σημερινό κεντρικό του κτήριο, το οποίο κατασκευάστηκε για το σκοπό αυτό. Λόγω ελλείψεως επαρκών χώρων στέγασης, για μια 4ετία, 1996-2000, λειτούργησε συστεγαζόμενο με το τότε τεχνικό λύκειο στον Άγιο Κήρυκα. Μετά την προσθήκη μιας νέας πτέρυγας στο κτήριο, το σχολείο επέστρεψε στη φυσική του θέση, στο Καταστάρι, τον Ιανουάριο του 2000, όπου και λειτουργεί μέχρι σήμερα.
